Clase4

En esta clase, nos adentraremos en las estimaciones de captura-recaptura mediante RMark. Para utilizar este paquete, será necesario instalar previamente el programa MARK. Durante el curso, se enseñará detalladamente tanto la instalación como el uso de este paquete.

Esta sección se encarga de instalar el paquete RMark necesario para nuestras evaluaciones.

Instalar y Carga del paquete

install.packages("RMark")

library(RMark)

Warning: package 'RMark' was built under R version 4.3.2

This is RMark 3.0.0
 Documentation available at http://www.phidot.org/software/mark/rmark/RMarkDocumentation.zip

Aquí se importa la base de datos “example.txt” para su uso en nuestros análisis. En la clase utilizaremos base de datos reales y caso de estudios reales.

reid <- import.chdata("data/example.txt")

Visualización de los primeros datos

head(reid)

    ch    sex weight
1 0011 Female   2.96
2 0010 Female   3.09
3 0010 Female   3.14
4 0010 Female   3.23
5 0011 Female   3.47
6 0011 Female    3.5

Ejecución del modelo

f0 <- list(formula=~1)
mb <- mark(reid, model="Closed", model.parameters=list(p=f0, c=f0))


Output summary for Closed model
Name : p(~1)c(~1)f0(~1) 

Npar :  3
-2lnL:  -3391.001
AICc :  -3384.991

Beta
                 estimate        se        lcl        ucl
p:(Intercept)  -0.6422980 0.1139675 -0.8656743 -0.4189217
c:(Intercept)   0.6410908 0.0607266  0.5220666  0.7601150
f0:(Intercept)  4.9062121 0.2156520  4.4835341  5.3288900


Real Parameter p
         1         2         3         4
 0.3447273 0.3447273 0.3447273 0.3447273


Real Parameter c
     2     3     4
 0.655 0.655 0.655


Real Parameter f0
        1
 135.1266

Esta sección ejecuta el modelo para realizar el análisis de captura-recaptura.

Durante el curso, se cubrirán todos los detalles, desde la creación de la base de datos hasta la interpretación de los resultados.